1.生物质能源：生物质发酵生产绿色燃料甲烷、丁醇技术；

2.环境微生物：环境微生物资源挖掘及高效功能微生物在环境中的应用；

3.有机固废生物转化：合成微生物菌群驱动有机固废定向生物转化技术及代谢调控机制。

1.中国循环经济协会科技进步奖二等奖，2022；

2.中国科学院特聘研究骨干，2022-2026；

3.中国科学院青年创新促进会会员，2015-2018；

4.上海市浦东新区“明珠计划”明珠工程师，2024；

5.中国科学院上海分院第二届“三八红旗手”，2025；

6.上海理工大学，兼职研究生导师，2017-今；

7.江苏省泰州市高层次创新创业人才，2018；

8.福建省特技特派员，2018-2025；

9.中国科学院上海高等研究院研究生导师最佳人气奖，2024；

10.中英联合科学创新基金暨牛顿基金，2015。

1. 国家重点研发计划，城镇易腐有机固废生物转化与二次污染控制技术，课题负责人，2018.12-2022.12； 

2. 国家重点研发计划，林木资源生物共转化醇类燃料与增值联产技术，子课题负责人，2019.12-2022.12； 

3. 国家自然科学基金面上项目，餐厨垃圾厌氧发酵合成微生物菌群构建及协同产甲烷代谢调控机制，项目负责人，2025.01-2028.12； 

4. 国家自然科学基金青年项目，金属盐离子选择性定向解聚半纤维素的机理研究，项目负责人，2014.01-2016.12； 

5. 中国科学院专项任务，西部盐碱地综合改造利用技术验证，技术骨干，2024.04-2030.12； 

6. 中国科学院青年创新促进会人才项目，项目负责人，2015.01-2018.12； 

7. 中国科学院STS项目，木质纤维素类生物质生产液体燃料关键技术研究，子课题负责人，2015.06-2017.06； 

8. 中国科学院洁净能源创新研究院合作基金项目，木质纤维素混合生物质生产液体燃料丁醇关键技术研究，技术骨干，2018.10-2020.09； 

9. 上海市自然科学基金面上项目，合成微生物菌群构建及其驱动餐厨垃圾厌氧发酵产甲烷代谢调控机制，项目负责人，2024.10-2027.09； 

10. 上海市科委双碳专项，沼渣低碳高值化利用关键技术研究与示范，技术骨干，2021.11-2024.10； 

11. 上海市科委科研计划项目，规模化养殖场粪污处理技术集成研究与示范，技术骨干，2016.10-2019.09； 

12. 上海市科委科研计划项目，生物燃料丁醇的生产与车用关键技术研究与示范，技术骨干，2010.09-2012.09； 

13. 上海市农业科技创新项目，盐碱地土壤修复与改良剂研制，子课题负责人，2024.02-2026.10； 

14. 上海市科技兴农重大项目，施连作障碍土壤改良新型调理剂的研制与应用，子课题负责人，2021.05-2024.04； 

15. 上海市科技兴农重点项目，崇明稻田土壤生态改良关键技术研究与示范，子课题负责人，2019.04-2021.04； 

16. 上海市科技兴农重点项目，基于资源循环利用的凡纳滨对虾生态养殖技术研发与示范，子课题负责人，2021.05-2024.04； 

17. 上海市科技兴农重大项目，智慧、健康、生态、美丽一体化猪场关键技术集成示范，技术骨干，2019.04-2022.04 

18. 上海市浦东新区科技发展基金，设施菜田次生盐渍化土壤生物改良技术研究与应用，项目负责人，PKJ2024-N07，2024.10-2026.09 

19. 上海市浦东新区科技发展基金，微生物强化易腐有机固废多组份协同干式厌氧发酵技术研究与示范，项目负责人，2020.08-2022.07； 

20. 福建省-中国科学院STS项目，城镇河道原位生物修复技术研究与示范及在“一带一路”国家推广，子课题负责人，2018.04-2021.03； 

21. 企业横向，厌氧功能微生物筛选及强化有机废弃物厌氧发酵生产有机碳源和甲烷技术研究，项目负责人，2025.04-2027.12； 

22. 企业横向，微生物强化餐厨垃圾和作物秸秆多组份协同厌氧发酵产甲烷技术研究，项目负责人，2025.01-2026.03； 

23. 企业横向，生物干化过程快速启动及优势微生物的筛选，项目负责人，2021.02-2022.12； 

24. 企业横向，餐厨垃圾和生态厕所好氧生物处理微生物菌剂研发，项目负责人，2019.09-2022.08； 

25. 以色列FuturaGene公司国际合作项目，生物质能源树种生产液体燃料及能值分析评估，项目负责人，2013.07-2015.12。

1.论文

 [1]Liang C, Xie B, Su Y, Shi J, Liu L*, Zhang S*. Mechanistic insights into the attenuation of antibiotic resistance genes in thermophilic anaerobic co-digestion of food waste: A comprehensive metagenomic and absolute quantification study. Chem. Eng. J., 2025, 505:15979[4]  

[2] Shi J, Zhang S, Xiao M, Wang N, Hu P, Shi J, Tang T, Liu L*. Investigation of start-up strategies and temperature regulation on enhanced methanogenesis in anaerobic digestion of food waste. Chem. Eng. J., 2024, 498:15519[8]  

[3] Xiao M, Wang N, Zhang S, Hu P, Xie B, Shi J, Liu L*. Synergistic bioaugmentation with Clostridium thermopalmarium and Caldibacillus thermoamylovorans improved methane production from thermophilic anaerobic digestion of food waste. Chem. Eng. J., 2024, 480:14837[2]  

[4] Zhang S, Liang C, Xiao M, Chui C, Wang N, Ji Y, Wang Z, Shi J*, Liu L*. Metagenomic characterization of the enhanced performance of multicomponent synergistic thermophilic anaerobic co-digestion of food waste utilizing kitchen waste or garden waste as co-substrate. Water Res., 2023, 244:12045[7]  

[5] Zhang S, Xiao M, Liang C, Chui C, Wang N, Shi J, Liu L*. Multivariate insights into enhanced biogas production in thermophilic dry anaerobic co-digestion of food waste with kitchen waste or garden waste: Process properties, microbial communities and metagenomic analyses. Bioresour. Technol., 2022, 361:12768[4]  

[6] Liang C, Wei D, Yan W, Zhang S, Shi J, Liu L*. Fates of intracellular and extracellular antibiotic resistance genes during the cattle farm wastewater treatment process. Bioresour. Technol., 2022, 344:12627[2]  

[7] Wang N, Chen X, Ji Y, Yan W, Chui C, Liu L*, Shi J. Enhanced sludge reduction during swine wastewater treatment by the dominant sludge-degrading strains Chryseobacterium sp. B4 and Serratia sp. H[1]  Bioresour. Technol., 2021, 330:12498[3]  

[8] Chen X, Liu Q, Wang N, Liu C, Shi J*, Liu L*. Enhancing biomass conversion: Efficient hemicellulose removal and cellulose saccharification in poplar with FeCl3 coupled with acidic electrolyzed water pretreatment. Int. J. Biol. Macromol., 2023, 253:127600. 

[9] Chen X, Liu Q, Li B, Wang N, Liu C, Shi J*, Liu L*. Unveiling the potential of novel recyclable deep eutectic solvent pretreatment: Effective separation of lignin from poplar hydrolyzed residue. Int. J. Biol. Macromol., 2024, 259:12935[4]  

[10] Chen X, Li Y, Li X, Shi J*, Liu L*. Exploring the potential of multiple lignocellulosic biomass as a feedstock for biobutanol production. Fuel, 2024, 357:12969[7]  

2.专利 

[1] 一种强化有机固废厌氧发酵产甲烷的菌种及其应用，ZL20221128833[7] 8 

[2] 一种有机固废高温好氧堆肥菌种及其应用，ZL20211037055[2] 1 

[3] 一种有机固废高温好氧生物减量菌种及其应用，ZL20211027328[5] 6 

[4] 一种易腐有机固废生物干化菌种及其应用，ZL20211024872[7] 1 

[5] 一种拆解分离林木生物质组分的方法，ZL20231008429[9] 2 

[6] 一种耐盐碱促生菌及其在盐碱地改良中的应用，ZL202010074830.4 

[7] 一种生态厕所粪污处理菌种及其应用，ZL20201008876[8] 4 

[8] 一种具有好氧反硝化能力的粘着剑菌及其应用，ZL20231071152[7] 4 

[9] 一种COD降解菌种及其应用，ZL20201071460[9] 0 

[10] 一株低温脱氮除磷菌及其应用，ZL20191075961[5] 5